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Análisis bioinformático para abordar diferencias sexuales del sistema inmune y metabólico placentario humano
Franco Aguilera1,2 - Julieta Avalos1 - Esteban Grasso 1 - Claudio Schuster 2 - Rosanna Ramhorst 1 - Cesar Meller 3 - M A Martí 2 - Claudia Pérez Leirós 1 - Daiana M. Vota 1 - Daniel E Paparini1
1 Universidad de Buenos Aires (UBA), Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (IQUIBICEN-CONICET), Laboratorio de Inmunofarmacología, Buenos Aires, Argentina
2 Universidad de Buenos Aires (UBA), Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Departamento de Química Biológica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (FCEN), Instituto de Química Biológica (IQUIBICEN-CONICET), Laboratorio de Bioinformática, Buenos Aires, Argentina
3 Hospital Italiano de Buenos Aires, Servicio de Obstetricia, Buenos Aires, Argentina
Las diferencias biológicas sexuales influyen drásticamente en la regulación inmunológica y metabólica. Recientemente, se comprobó que estas disparidades persisten en la interfase materno-fetal, siendo determinantes clave para la fisiología placentaria. Aún se desconoce cómo tales diferencias en los macrófagos (MA) placentarios divergen transcripcionalmente de los periféricos. Aquí, empleamos bioinformática sobre bases de datos de MA periféricos polarizados a M1 y vellosidades placentarias humanas para investigar firmas transcriptómicas dependientes del sexo. En MA M1, analizamos microarrays de un solo color normalizados, identificando genes sesgados por sexo con limma y confirmando la segregación mediante un heatmap del cromosoma Y. Para las vellosidades a término, según el sexo del neonato, usamos matrices RNA-seq crudas normalizadas por mediana de razones, filtrando genes de bajo conteo y evaluando calidad con MA plots y curvas de rechazo. Los análisis de enriquecimiento con GSEA y gseapy abordaron rutas inmunológicas y metabólicas; las redes se construyeron con Gephi. Los MA femeninos mostraron mayor expresión de genes antiinflamatorios y de activación alternativa. En la vellosidad, los genes diferenciados por sexo se asociaron a modulación inmune antiinflamatoria, metabolismo lipídico y de aminoácidos, sobre todo en muestras femeninas. La integración mediante redes destacó la conectividad específica de cada sexo y reveló la asociación entre genes diferencialmente expresados ligados a cromosomas sexuales, usualmente excluidos. Estos hallazgos sugieren una similitud entre el dimorfismo sexual en macrófagos periféricos y las vellosidades, las cuales contribuyen a adaptaciones inmunometabólicas diferenciales durante el embarazo, destacando el valor de la bioinformática para desentrañar mecanismos moleculares complejos en la biología placentaria.
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